Diakonia przy Parafii Ewangelicko-Reformowanej w Warszawie, zwana Diakonią warszawską, jest częścią Diakonii Kościoła Ewangelicko-Reformowanego w RP. Diakonia jest organizacją charytatywną skupiającą grupę wolontariuszy, których służba polega na udzielaniu wsparcia i opieki nad osobami starszymi, schorowanymi, niepełnosprawnymi, samotnymi i ubogimi.
Przewodnicząca/-y Diakonii z urzędu wchodzi w skład Kolegium Kościelnego.
Obecnie Przewodniczącą Diakonii jest diakon Monika Polkowska (
Pracownicy socjalni – Elżbieta Sobolewska i Krzysztof Bandoła-Skierski
Do głównych zadań Diakonii należą:
- utrzymywanie stałego kontaktu z podopiecznymi,
- odwiedziny w szpitalach i domach opieki,
- udzielanie wsparcia duchowego i opieki psychologicznej,
- udzielanie wsparcia finansowego,
- organizacja kiermaszy i loterii na cele charytatywne
Diakonia warszawska pełni dyżury w środy w godz. 10.00-12.00 i w niedziele po nabożeństwie.
Ks. Michał Jabłoński jest proboszczem parafii od roku 2008. Absolwent Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej w Warszawie i wydziału teologii ewangelickiej New College Uniwersytetu w Edynburgu. Ordynowany na pastora KER 25 maja 1995 r. Przed objęciem parafii warszawskiej służył w parafiach w Pstrążnej i Strzelinie. 
